Dalam film kedua di Kelvin timeline ini, musuh utama James T Kirk dan Spock adalah Khan, manusia hasil rekayasa genetic yang memiliki kemampuan di atas manusia biasa.
Kelvin timeline adalah reboot dari franchise star trek pada tahun 2009. Ada 3 judul film dalam kelvin Timeline: Star Trek (2009), Star Trek in to Darkness (2013), Star Trek Beyond (2016). Kelvin Timeline dibintangi oleh Chris Pine sebagai kapten James T Kirk dan Zachary Quinto sebagai Spock.
Star Trek in to Darkness (2013)
Khan meledakkan perpustakaan yang mengharuskan seluruh pemimpin armada Starfleet melakukan pertemuan. Saat pertemuan sedang berlangsung, Khan menyerang dan membunuh beberapa pimpinan armada Starfleet.
Khan berusaha membalas dendam kepada pimpinan Starfleet yang Bernama admiral Marcus, karena menyandera 72 anak buahnya di dalam torpedo.